食用菌的原種、栽培種接種后萌發(fā)不正常主要表現(xiàn)為兩種情況，一是不萌發(fā)或萌發(fā)緩慢；二是萌發(fā)出的菌絲纖細無力，擴展緩慢。其發(fā)生原因的分析思路：培養(yǎng)溫度→培養(yǎng)基含水量→培養(yǎng)基原料質(zhì)量→滅菌過程及效果→母種/原種。對于接種物不萌發(fā)、或萌發(fā)緩慢、或擴展緩慢來說，這幾個方面的因素必有其一，甚至可能多個因子共同影響。

　　一、培養(yǎng)溫度過高或過低

　　培養(yǎng)溫度過高或過低會造成接種物不萌發(fā)、萌發(fā)遲緩、生長緩慢。

　　二、含水量過高或過低

　　盡管拌料時加水充足，但由于拌料不均勻，造成培養(yǎng)基含水量的差異，含水量過高或過低的菌種瓶（袋）接種物萌發(fā)緩慢

　　三、培養(yǎng)基原料霉變

　　正處霉變期的原料中含有大量有害物質(zhì)，這些物質(zhì)耐熱性極強，在高溫下不易分解變性，甚至在高壓高溫滅菌后仍然保留其毒性，接種后菌種不萌發(fā)。具體確定方法是將培養(yǎng)基和接種塊取出，分別置于PDA培養(yǎng)基斜面上，于適宜溫度下培養(yǎng)，若不見任何雜菌長出，而接種塊萌發(fā)、生長，即可確定為這一因素。

　　四、滅菌不徹底

　　培養(yǎng)基內(nèi)留有大量細菌，而不是真菌。培養(yǎng)基中殘留和繼續(xù)繁殖增加的細菌，多數(shù)情況下無肉眼可見的菌落，有時在含水量過大的瓶（袋）壁上，在培養(yǎng)基的顆粒間可見到灰白色的菌膜。多數(shù)食用菌在有細菌存在的基質(zhì)中不能萌發(fā)和正常生長。具體檢驗方法如下：在無菌條件下取出菌種和培養(yǎng)料，接種于PDA斜面上，于適溫條件下培養(yǎng)，24-28小時后檢查，在接種物和培養(yǎng)料周圍都有細菌菌落長出。

　　五、母種（原種）菌齡過長

　　菌種生產(chǎn)者應使用菌齡適當?shù)哪阜N，多種食用菌母種使用最佳菌齡都在長滿斜面后1-5天，栽培種生產(chǎn)使用原種的最佳菌齡在長滿瓶（袋）14天之內(nèi)。在計劃周密的情況下，母種和原種生產(chǎn)、原種和栽培種的生產(chǎn)緊密銜接是完全可行的。若母種長滿斜面后一周內(nèi)不能使用，要及早置于4-6℃環(huán)境中保存。